このお寺は、文禄四年（1959)に正善院日堂上人が江戸八丁堀（現中央区）に堂宇を構え布教したことに始まり、これから約五十年後の正保元年(1644)には浅草八軒寺町（現台東区寿）に寺領を移し、長くこの地にあった。ところが、昭和二十年（1945)三月十日の東京大空襲にあって焼失したため、昭和二十三年（1948)五月に現在の地に移転、再建したものである。 寺名は、日堂上人が佛門に入る時、中将位にあり、大仙と号していたので、この官名と号から人々が親しみをこめて中将山大仙寺と呼んだことに由来する。浅草時代のこの寺は、宗門最高寺院の貫首などを多数輩出したことから出世寺と呼ばれた名刹であった。また、学僧の寺としても、役僧の隠居寺としても名高い寺であった。 参道入口に柳の大樹のあったところから、通称柳寺とも呼ばれ、また子安鬼子母神の守護寺として庶民の信仰を集めていた。現本堂裏の墓地に江戸末期の有名な浮世絵師　歌川国芳の墓がある