当山の開基、利玄院日義上人は、徳川家康公の囲碁の師匠であり、先代の日衆上人口伝によれば、家康公より神田鍛冶橋に寺領を与えられ、永隆寺を創建する。その後、寛永年間に谷中清水町に移転。さらに元禄４年（1691）、本所出村（後の太平町）に再移転となる。　関東大震災後、昭和３年（1926）に現在の地、烏山に移転するまでの２３７年間、永隆寺は本所太平町にあった。本所太平町は地盤が低くしばしば水害にあったため、残念ながら古記録などは流出してしまい現存しない。